2664年，约翰·薛帕德的直系后人卡斯特·薛帕德被议会选中，成为一名“幽灵“特工。”幽灵”特工是银河议会的最高执法单位，总共只有200人，他们直接向议会负责，他们无需遵守议会法律，只需要按照“幽灵”条例行事，他们无论走到哪里都拥有最高权限，他们所使用的武器设备均是银河议会最先进的。除此之外，“幽灵“特工还被允许拥有自己的座舰，组建自己的军团。但相对的，“幽灵”特工们执行的任务都是最难且危险的，清剿星际海盗、处理大宗犯罪、探索未知区域等等都在“幽灵”特工的工作范围内。
卡斯特·薛帕德的祖父是约翰·薛帕德与伊曼欧·凯莉·钱伯斯的私生子，约翰·薛帕德的妻子是阿莎丽人莉亚拉·t·苏尼，两人虽发生过关系但并未“中标”，曾经担任过约翰·薛帕德秘书的伊曼欧·凯莉·钱伯斯在一次风险极大的任务前为了减压与约翰·薛帕德发生了关系，随后约翰·薛帕德为了延缓收割者入侵炸毁了一个位于巴塔瑞人殖民地的质量中继器导致大量伤亡，星联因此将约翰·薛帕德软禁，在此期间，伊曼欧·凯莉·钱伯斯产下一子，取名为·薛帕德，虽然同姓，但没人将·薛帕德与约翰·薛帕德联系到一起。伊曼欧·凯莉·钱伯斯在反收割战争中身亡，·薛帕德在战后整理自己母亲遗物时才发现自己是约翰·薛帕德的私生子，但是·薛帕德不希望银河系的英雄背上“和船员乱搞”的骂名，没有将这些信息公开。后来，·薛帕德与一名人类女性产下一男一女，分别取名为迈尔斯·薛帕德和莉莉丝·薛帕德，·薛帕德和妻子死后，迈尔斯·薛帕德和莉莉丝·薛帕德发现了当年被伊曼欧·凯莉·钱伯斯遗留下来的文件，迈尔斯·薛帕德希望通过这些文件来让自己获得更高的社会地位，而莉莉丝·薛帕德则认为这种做法属于投机取巧、不劳而获，坚决反对迈尔斯·薛帕德的决定，双方因此起了冲突，争执中，迈尔斯·薛帕德不慎引爆了家中的爆炸物，莉莉丝·薛帕德意外身亡，迈尔斯·薛帕德因此入狱，而执法的当地警员也发现了伊曼欧·凯莉·钱伯斯留下的文件并向议会进行了汇报，迈尔斯·薛帕德也承认了想利用这些文件谋利的意图，后来议会将事情公开，迈尔斯·薛帕德在出狱后一直遭人唾弃。为了延续血脉，迈尔斯·薛帕德与一名阿莎丽族妓女产下一子后就饮弹自尽，那名与阿莎丽妓女产下的私生子便是卡斯特·薛帕德。
卡斯特·薛帕德被送到地球上的一处托管机构抚养，迈尔斯·薛帕德为了让卡斯特·薛帕德平安成长，只是托人把卡斯特·薛帕德以孤儿的名义送到了托管机构。然而卡斯特·薛帕德从小天赋秉异，智勇双全，卡斯特·薛帕德在27岁时就通过了人类星联最高等级的特种部队——n7特种部队的考核成为了其中一员，在加入了“n7”后，由于超强的个人能力，军队高层注意到了卡斯特·薛帕德，一名军官在查看了卡斯特·薛帕德的资料后，发现卡斯特·薛帕德这个名字不是一个巧合，他正是银河英雄约翰·薛帕德的后裔。于是这名军官找到了卡斯特·薛帕德，向他说明了情况，卡斯特·薛帕德听了之后并没有太大的反应，他告诉自己的长官，自己是一名孤儿，军官听了卡斯特·薛帕德的回答，认为这样的情况也情有可原，毕竟迈尔斯·薛帕德的劣迹可是人尽皆知，为了延续血脉将一个私生子“隐瞒”下来也不是不可能，试想如果当初迈尔斯·薛帕德没有将卡斯特·薛帕德“隐瞒”的话，卡斯特·薛帕德的成长道路恐怕不会如此顺利。事后卡斯特·薛帕德给出的评价是：“如果迈尔斯·薛帕德就是我的亲生父亲，那可真是糟糕，我不会向他学习，我应该学习的对象是我的先祖——约翰·薛帕德。”卡斯特·薛帕德认为，如果自己不做点什么，薛帕德血脉的名声恐怕要一落千丈了，好在银河议会先进的生物科技使各族人民的平均寿命都达到了千年以上，这样一来，留给一个人学习或是积累的时间就非常多了，卡斯特·薛帕德向上级申请了进入人类星联最高等学府——格里斯姆学院进修，上级很快批准了他的请求，往后的一个世纪卡斯特·薛帕德是在各种训练和学习中度过的。
2662年，在议会首府空间站“神堡”，的赫塔纪念医院，几名赛拉睿科学家进行了一项关于异能者的实验，生物异能是一种特殊的个人能力，通过运用脑内的电子脉冲能够熟练控制暗能量和创造质量效应场，生物异能的产生条件是接受恰到好处的零号元素辐射，而零号元素则是舰船质量效应核心所采用的燃料，进行超光速航行的必须品，但零号元素并不稀有，在宇宙空间中到处都是，反收割战争结束后，科学家们发现，控制零号元素辐射的强弱，让人以特定的规律接受辐射的话，不仅不会因此伤害的人体，而且觉醒异能的概率是100%，后来，人们把这种辐射称为“造神辐射”。但是仅仅接受造神辐射后所觉醒的异能者只能算是最普通的异能者，如果想要成为一名强大的异能者必须经过长时间的专项训练。然而来到”神堡“的几名赛拉睿科学家自称研发了一种投机取巧的途径，能够让异能者瞬间永久性的大幅提升能力，他们来到赫塔纪念医院寻找志愿者，刚从医院中出来的卡斯特·薛帕德撞见了这伙赛拉睿人。卡斯