道家内丹术是以炼精化气、练气化神、炼神还虚、炼虚合道为修炼次第，而《阴阳炼心经》则反其道而行之，先从神开始修炼。这种修炼方法比内丹术更难，非上等根器者不能有所成。由此可见，林木的修行资质之好。
《阴阳炼心经》分总论和修炼次第两部分。
总论主要讲述了本功法的理论基础以及核心理念。主要有：
本心道心论
修心始终论
三魂七魄说
三脉七轮说
魂能附体说
太极阴阳图
修炼次第有六步：
入定
开识海
观想
引灵
炼魂
化神
入定、开识海、观想是功法的准备阶段，这一时期还没有炼化魂力的能力，所以尽量不要杀生，以保持灵魂的纯净。
入定就是入于禅定，禅定分四禅八定，灭尽定和他们的准备阶段欲界定。佛教把我们的世界分为欲界、、无色界。欲界修欲界定，修四禅定，无色界修四无色定。心经只要求修欲界定和四禅定，因为后面的禅定太深奥，很少有人修成，就是达到四禅的人也是少之又少。而且没有大量的灵气支持，也很难进入高深的境界。
四禅也称为不动定，心如明镜不动，清净明朗。到此时，可以进入下一个阶段——开识海。修到这个境界，林木用了七年。
意守上丹田泥丸宫，久之自有一股玄妙的能量从大脑深处涌出，轰隆隆响声不绝，雾气翻滚，如开天辟地般形成了一个空间，它就是灵魂的居所识海。识海是一个神奇的空间，它不在身内也不在身外，却又依附于身体，它不同于物质世界，也和婷婷的次元空间有区别。在我们生活的物质界，物质与能量并存，但识海中只能存在能量体。
开辟识海并稳固识海林木只用了一年时间。
观想即在识海中观想太极阴阳图。林木直到前几天才完成观想。
太极图虽然看似简单，但它却包含着大道至理。
正所谓道生一，一生二，二生三，三生万物；即无极生太极，太极生两仪，阴阳化合而生万物。
阴阳相互对立，又你中有我，我中有你（阴中有阳，阳中有阴）。
林峰本想观想完整的太极图，但两个鱼眼怎么也观想不出来，后来就放弃了。所以心经中观想的太极图是一个没有鱼眼的残图。
经过长时间的修炼和研究，根据“阴极而生阳，阳极而生阴”的理论，林峰认为当残图吸收的日华和月华到一定程度时，残图将开始进化。阳鱼中的日华将升华为太阳真火，阴鱼中的月华将升华为太阴真水，太阳真火中蕴育出月华，太阴真水中蕴育出日华，正所谓太阳生少阴，太阴生少阳。根据林峰的推测，此时的太极图可能会成为一件法宝，可虚可实，虚者炼魂炼形，实者可出体外攻敌护身，其中妙用还需后来者进行探索。
引灵者引日月精华也。
初次引灵要去远离城镇的地方，因为城市的光污染很严重，会干扰意识与日月精华的共鸣沟通，即使引灵成功也会使日月精华驳杂不纯。初次引月华最好是在月圆之夜，这时的月华最充盈精纯。初次引日华要在太阳初生之时，这时的日华充满生机又不显酷烈。待适应初生的太阳时，可把修炼的时间逐渐向中午推移，当能够在中午修炼时，那引灵这一步算是小成，可以在一天当中任何时候修炼。
炼魂者即炼化亡者传入的异己魂力也。
小时候林木对这一步的原理很难理解，为什么人杀生（不止是人）
后，会得到一股精神能量（魂力），这即视感是不是很像游戏里的打怪得经验升级呢？只不过现实中不能直接利用，必须进行炼化，不然就会慢慢消散。
为了对修炼原理有更多的研究，林木大学读的是人体生命科学。他四年时间研读了生命科学的多个专业，经过多年研究，他对炼魂这一步有了自己的认识。
大脑无时无刻不在向外散发脑电波，脑电波是一种能量，所以人每天需要食物和随眠来补充大脑缺失的能量。脑电波有不同的频率，频率越高能量越大，而情绪越激烈则脑电波频率越高，所以各门各派修炼时都要求收视反听、平心静气。收视反听才能不被外缘所扰，更能平心静气减少精气神（神即魂力、脑电波，由精气转化而来，精气由食物、水、空气等转化而来）的损失。当人或动物临死时，他的情绪波动最为剧烈，对生的留恋，对凶手的憎恨，使他在生命最后一刻发出了蕴含了巨大能量的脑电波，这股能量是定向的，绝大部分会被凶手吸收。如果不懂炼化之法，这股能量绝大部分会消散掉，只有一小部分会顽固的附着在灵魂上，影响人的心智。这也是为什么有的人杀人之后会性情大变，甚至人格扭曲。
经过观察，林木还发现，智慧越高的生物死前所发出的脑电波能量越大。
化神者，凝聚三魂七魄化为元神，此时的元神也称为阳神。
命魂在不断地吸纳魂力，壮大到一定程度时，就会吸引地魂、天魂、七魄先后与他聚合，最后成为阳神。
林峰就是在凝聚了天地人三魂达到阴神境界时修为停滞不前，无论他怎么吸纳魂力，魂力都会很快消散不见，这是因为他的灵魂强度不够。此时他有两个选择：其一，待太极图进化出太阳真火和太阴真水，对魂魄进行炼化。但他不敢进化太极图，因为他预感如果